Neo-10Neosuite TCMD 中藥化學數據庫

(Traditional Chinese Medicine Database, NeoSuite)

      創騰科技有限公司和中科院過程工程研究所分子設計課題組聯合開發的綜合性中藥化學數據庫。Neosuite TCMD 中藥化學數據庫是在中藥研究者*從事藥物設計方法研究的背景下，對數據庫工具的國內外需求進行分析，經多年努力研制成功的科學數據庫產品，是一個支持新藥研發和中藥現代化研究的新型工具。TCMD數據目前收集了中藥化合物23033種，每種中藥化合物包含下列11項數據：代碼、CAS登錄號、中文名稱、英文名稱、分子式、分子量、二維結構式、植物來源、藥理活性（即藥理模型實驗結果，近8000多種化合物有此數據）、物理化學性質（晶體形態、熔點、沸點、旋光度等，14000多種化合物有此數據）和參考文獻。TCMD數據庫涉及到的中藥藥用植物有6735種，使用的參考文獻有5507多篇。

產品介紹
     Neosuite TCMD 中藥化學數據庫 (Traditional Chinese Medicines Database，TCMdb2009中文版) 是中科院過程工程研究所分子設計課題組在*從事藥物設計方法研究的背景下，對數據庫工具的國內外需求進行分析，經多年努力研制成功的科學數據庫產品，是一個支持新藥研發和中藥現代化研究的新型工具。

     TCMdb2009中文版是一個多學科交叉的科學數據庫，涉及中藥現代化研究、中藥化學、藥物化學、植物化學、化學信息學、中藥藥理學、分子藥理學、藥物設計學、天然產物研究與開發、新藥創制、新劑型中藥研發、新農藥及其它農用化學品的研發等諸多研究及開發領域。

      TCMdb2009中文版中包含了23033種化合物，涉及中藥藥用植物6735種，使用參考文獻5507篇。每種化合物下列12項數據：代碼、CAS登錄號、中文名稱、英文名稱、別名、分子式、分子量、二維結構式、植物來源、藥理活性（即藥理模型實驗結果，近8000多種化合物有此數據）、物理化學性質（晶體形態、熔點、沸點、旋光度等，14000多種化合物有此數據）和參考文獻。

產品特點：

 • 8000種成分有藥理數據：200種細胞水平抗癌模型；細胞因子網絡調節機制抗炎模型；各種抗氧化模型；各種酶抑制劑模型；NO抑制劑模型等等。

 • 信息表達體系完整嚴格：按規范全面定義了中英名稱、化學結構、各類數值、生物活性等數據結構、層次及格式，使相關學科信息表達和接軌。

 • 保證數據*性可靠性：采用多種交叉驗證方法保證信息準確可靠。化合物立體化學表達完整，并*實現了藥理數據多層次結構規范化。

     無論您是從中藥設計新西藥，還是研發新劑型新中藥，都可以把TCMdb中藥數據庫作為一種得力的工具，幫助您以zui快速度分析并做出決策，解答任何與中藥有關的問題：
 

 • 有多少化學成分做過抗癌實驗，哪些有活性？哪些沒有？IC50值多少？

 • 以心血管藥物為研發目標的公司應該關注哪些中藥的研發動態？

 • 從中藥出發創制抗高血壓新藥，哪些資源成功希望zui大？

 • 黃酮類化合物有多少種藥理活性？哪些活性譜zui廣？

 • 中藥傳統藥效有清熱、安神、解表、活血等，對應的藥理學概念是什么？

應用實例：

• 從植物檢索化合物
     給定一種中藥藥用植物，問該種植物都含有哪些化合物？ 嚴格的說法是：都有哪些化合物被從該種植物中分離并進行了結構確定？，TCMdb2009中文版數據庫能方便地完成這個任務。以三七為例，單擊菜單欄下方的“Query”按鈕，在query模式下激活“植物來源”域，鍵入“Like “%三七%””時，單擊菜單欄“Search”按鈕，單擊下拉菜單中的“By Form”，系統將擴展地檢出各種三七中含有的全部化合物，包括竹節三七等。

• 化合物藥理活性數據檢索
     在全庫的 23033 種化合物中，7000 種化合物有藥理活性數據。這是研究 QSAR/SAR 關系的珍貴信息。用 SBF 方式，激活“藥理活性”域后，鍵入“Like “%藥理關鍵字%””，之后單擊菜單欄 “Search” 按鈕，單擊下拉菜單中的 “By Form”，就得到下表中的結果。亦可采用 QB 方式，見下表中中間的三個例子：

注意: 體外抗癌活性在庫中的規范表達方式是“細胞毒”，體內抗癌活性在庫中的規范表達方式是“抗腫瘤”。觀察化合物生物活性索引中的生物活性規范表達方式對于熟練使用數據庫是有好處的。

• 結構檢索
     結構及子結構檢索是 TCMdb2009 中文版*的功能。這一功能的實現對進行 QSAR 研究，進而研發新藥提供了巨大的幫助。這里只舉出zui簡單的例子：將黃酮類化合物的特征分子骨架放入 SBF 方式下的 structure 檢索域，從庫中檢出包含黃酮骨架的化合物 511 個。具體命令見 2.2 節。用 β-D-葡萄糖的分子骨架(含確切的立體化學信息)提問，得到 1455 個命中化合物。其它例子見下表：

• 用戶評價
     TCMdb 中藥數據庫2009年新版和科學出版社近日發行新書《中藥原植物化學成分集》基本相同，但文字/數值/結構復合型數據庫具有任何紙質書本不可能具有的強大檢索功能，和《中藥原植物化學成分集》配合使用，相得益彰，是*的結合。國內專家對《中藥原植物化學成分集》一書的評論摘要如下：

    “該書為中藥的現代化研究搭建了一個很好的信息平臺，達到了上同類工作的*水平”（醫科院藥用植物所肖培根院士）

     “該書內容豐富，資料完整，反映了國內外研究成果，對于充分利用我國中藥資源，促進中藥現代化研究，提升我國創新藥物研究水平，具有重要的科學價值“（中國藥理學會杜冠華理事長）

      “該書為用綜合方法系統研究中藥*提供了一套兩萬種以上中藥化學成分的數據集合……在理論層面上對臨床實踐有重要參考價值”（中醫*翁維良*研究員）

      除了該數據庫，直接用于受體對接、創建3D藥效團的TCMdb-2009-SCB/MCB單/多構象庫也同步發行。

數據收集評價和庫研制：NiceData 北京翔實達特軟件研究開發中心
軟件開發及數據庫發行：NeoTrident 創騰科技有限公司