暗猝滅劑（一種非熒光發色團）BHQ-3 NHS，871240-94-7

英文名稱：BHQ-3 NHS

CAS：871240-94-7

外觀：深紫色粉末

分子式：C37H38N7O4+

分子量：644.76

儲存條件：-20°C，避光避濕

結構式：

產品簡介：黑暗猝滅劑?-3染料寡核苷酸修飾。BHQ-3可以位于5或3末端或寡核苷酸的內部。BHQ?-3標記的寡核苷酸用于許多應用，包括用于實時PCR的雙標記熒光探針。該暗猝滅劑具有620-730 nm的強吸收范圍，可對在該范圍內發出熒光的熒光團（如Quasar?670和Quasar 705染料）進行很好的猝滅。

NHS修飾是合成后與一個伯氨基的共軛，因此是一個附加的需要用氨基修飾。C6或C12氨基可置于5&＃39;或對于3&＃39;端，使用C3或C7氨基，對于內部位置，使用氨基修飾的堿，例如氨基dT C6。基于NHS的產率修飾是使用伯氨基進行的合成后共軛。與可作為酰胺的直接自動化偶聯改性相比，產率較低。近似各種規模的產量如下所示。

50 nmol規模合成的***終產量約為2 nmol。

200 nmol規模合成的~5 nmol***終產量。

1μmol規模合成的~16 nmol***終收率

黑洞猝滅劑-1（BHQ-1）被歸類為暗猝滅劑（一種非熒光發色團），被***使用作為各種熒光共振能量轉移（FRET）DNA檢測探針中的3&＃39;-猝滅部分。這樣的探針主要用于核酸分析，但也可用于核酸結構研究（1）。例子包括TaqMan探針（2）、蝎子引物（3）和分子信標（4）。BHQ-1的吸光度為534 nm，有效吸光度范圍為480-580 nm。這是用于與熒光染料配對的猝滅劑，熒光染料在可見光范圍（519-556 nm）的黃綠色到黃色部分發射。這個染料的發射光譜與BHQ-1的吸收光譜充分重疊，從而使后者能夠淬滅染料前者熒光***。

在FRET探針中使用暗猝滅器的優點是低背景熒光（因此更好）信噪比，（b）更高的動態范圍，（c）適用于多重分析（由于暗猝滅器沒有二次熒光），以及（d）使用暗猝滅劑易于合成FRET探針（因為暗猝滅劑在低聚物脫保護步驟中抗降解）（5）。

作為核酸雜交探針檢測系統使用的各種熒光染料和猝滅劑分子的開發允許開發幾種不同的實時PCR分析系統，這些系統利用染料猝滅劑雜交探針，僅當它們與目標結合時才產生熒光信號。然而，為了正確設計針對特定目標的分析，重要的是根據分析中使用的雜交探針類型、待檢測的目標數量以及可用于執行分析的設備類型，仔細選擇雜交探針的染料和猝滅劑。

1） 選擇能被激發源和你計劃在實驗中使用的分光光度熱循環儀的光學元件適當激發和檢測的熒光染料。基于激光的激發源通常在窄波長范圍內（例如，氬離子激光器為500-540 nm）提供激發，而白光源（例如，鹵鎢燈）和發光二極管與激發和發射濾光片結合可在整個可見范圍（400-700 nm）內激發熒光團。

2） 對于用一個雜交探針檢測一個目標，建議對染料使用FAM、HEX或TET，因為它們可以在所有分光光度熱循環儀上檢測到，并且所有三種探針都可以使用磷酰胺（這使得探針的合成簡單且具有成本效益）。

3） 對于復合分析，至少需要兩種不同的雜交探針，應選擇吸收和發射波長分離良好的染料。

4） 對于FRET雜交探針，應選擇光譜高度重疊的熒光染料猝滅劑對。請參閱淬火劑選擇表以選擇適當的淬火劑。

5） 對于基于接觸猝滅的雜交探針（例如，分子信標），任何非熒光猝滅劑都應工作良好。

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